Такая культура часто применяется в научных исследованиях в качестве модели клеток человека, так как ее довольно просто растить в лабораториях.
Он также выразил надежду на то, что при помощи данного алгоритма можно будет использовать найденные в раковых клетках слабые места в качестве точек, в которые в дальнейшем будут бить медикаменты.
Михаил Горшков, — глава группы русских исследователей объявил, что в ближайшем будущем ему и его сотрудникам удастся положить конец проблемам белковых соединений, которые часто несут внутри себя серьезнейшие последствия для организма. Статья с результатами отечественных профессионалам была размещена в издании . Однако помимо этого, линия HEK-293 содержит внутри себя большое количество мутаций и именно поэтому может служить прекрасной моделью для тестирования протеогеномного подхода к исследованию рака.
Кроме собственных экспериментальных данных, в своей работе ученые использовали масс-спектры из 2-х работ, приуроченных исследованию протеома клеток HEK-293.
Для опыта ученые подготовили расширенную базу данных на основе результатов секвенирования экзома (совокупности участков генов, кодирующих последовательность аминокислот в белке) клеточной линии HEK-293. Секвенирование экзома дает возможность сосредоточить внимание исследователей только на белок-кодирующих генах, а кроме этого определить расположение в них. Вместо универсальной белковой базы данных в протеогеномных исследованиях используются базы, уникальные для исследуемых клеток, включающие информацию о вероятных прочтениях генома и его «перевод» в аминокислотную последовательность. База исследования возросла в конечном итоге на 1336 способов последовательностей. Без данной поправки поисковая программа не смогла бы найти такие немного «неправильные» белки. Таким образом, обнаружение белков, различающихся от «правильных», несомненно поможет ученым понять, чем раковая клетка отличается от нормальной.
Получив данные масс-спектроскопии по таким клеткам и расшифровав значимую часть их ДНК, авторы статьи подготовили целую информационную базу по белкам-мутантам в этих клетках, чье общее число, благодаря точности работы программы русских исследователей, возросло на 113 коротких молекул белков, содержащих внутри себя «опечатки». Некоторые из найденных мутаций уже связали с возникновением злокачественных опухолей. Следствием данного вполне может стать развитие рака. «Это, в свою очередь, несомненно поможет в изучении белкового состава опухолей и разработке препаратов, „нацеленных“ на мутантные белки, производимые в опухолевых клетках», — отмечает Михаил Горшков, один из управляющих проекта, заведующий лабораторией физико-химических методов исследования структуры веществ ИНЭПХФ РАН, работник Кафедры химической физики МФТИ.
